Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Q5VSD8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Q5VSD8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Q5VSD8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms