Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SAMD5Q5TGI4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms