Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF648Q5T619 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms