Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LDLRAP1Q5SW96 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LDLRAP1Q5SW96 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms