Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC39AQ5SRH9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC39AQ5SRH9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms