Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HSP90AB4PQ58FF6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms