Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KHDC3LQ587J8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms