Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SBK1Q52WX2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms