Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC184Q52MB2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms