Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TPRNQ4KMQ1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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