Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM176BQ3YBM2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms