Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL38Q2WGJ6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL38Q2WGJ6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms