Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FHOD3Q2V2M9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FHOD3Q2V2M9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms