Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IMPG1Q17R60 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IMPG1Q17R60 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms