Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDR2Q16832 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms