Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UPP1Q16831 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UPP1Q16831 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms