Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ME3Q16798 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ME3Q16798 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ME3Q16798 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ME3Q16798 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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