Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NDUFA9Q16795 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NDUFA9Q16795 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms