Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FXNQ16595 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FXNQ16595 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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FXNQ16595 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FXNQ16595 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
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