Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F4Q16254 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
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