Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NPTX1Q15818 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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