Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE3CQ15386 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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