Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TTF1Q15361 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TTF1Q15361 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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