Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PSMD6Q15008 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PSMD6Q15008 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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