Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NFIXQ14938 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
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