Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMC1AQ14683 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMC1AQ14683 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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