Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM53BQ14153 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM53BQ14153 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms