Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RUNX3Q13761 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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