Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms