Protein–RNA interactions for Protein: Q13636

RAB31, Ras-related protein Rab-31, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB31Q13636 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
RAB31Q13636 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RAB31Q13636 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms