Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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TUBB3Q13509 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TUBB3Q13509 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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TUBB3Q13509 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TUBB3Q13509 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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