Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PICALMQ13492 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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