Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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MKRN4PQ13434 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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MKRN4PQ13434 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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MKRN4PQ13434 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MKRN4PQ13434 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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