Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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ITGB3BPQ13352 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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ITGB3BPQ13352 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGB3BPQ13352 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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