Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CBX3Q13185 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CBX3Q13185 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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