Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAF3Q13114 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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TRAF3Q13114 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TRAF3Q13114 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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