Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MRPL28Q13084 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MRPL28Q13084 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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