Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TRAF1Q13077 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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TRAF1Q13077 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAF1Q13077 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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