Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms