Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GRIN2AQ12879 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIN2AQ12879 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
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