Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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RAB40BQ12829 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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RAB40BQ12829 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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RAB40BQ12829 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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RAB40BQ12829 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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RAB40BQ12829 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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RAB40BQ12829 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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RAB40BQ12829 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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RAB40BQ12829 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB40BQ12829 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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