Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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EFEMP1Q12805 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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EFEMP1Q12805 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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EFEMP1Q12805 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EFEMP1Q12805 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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