Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOBRQ0VD83 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms