Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC15Q0P6D6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CCDC15Q0P6D6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms