Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSRP1Q08945 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSRP1Q08945 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms