Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GRIN1Q05586 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms