Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF11Q05519 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms