Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms