Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CHRNEQ04844 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms