Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACVR1Q04771 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms